Después de mil pruebas con otros programas similares (soy noob puro en estos temas) al final lo conseguí con un programilla llamado Navicat for MySQL (fácilmente encontrable en los "lugares habituales"

)
El "bicho" se conecta a las bases de datos y se puede hacer con el todas las "perrerias" que quieras con ellas, en este caso fue crear un
Batch Job que hace un backup de la base datos que quieras y luego un
Set Task Schedule que crea una entrada en el programador de tareas de Windows.
Por lo visto hay otras mil maneras de hacerlo, como con un mysqldump mediante un cronjob en el servidor, etc..., pero esta manera es bastante fácil (cuando le pillas el truco, claro esta!!

)
Ya que estamos en el tema de las BD, échale un vistazo a este post, a ver si se te ocurre alguna idea:
http://arc.reglasdecalculo.org/index.php?topic=391.msg11441#msg11441 Basedatados Saludos